{"id":5647,"date":"2024-07-22T13:54:14","date_gmt":"2024-07-22T11:54:14","guid":{"rendered":"https:\/\/www.ptmyk.pl\/?p=5647"},"modified":"2024-07-22T13:54:14","modified_gmt":"2024-07-22T11:54:14","slug":"dolacz-do-fundive-projektu-poswieconego-lepszemu-poznaniu-roznorodnosci-grzybow","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.ptmyk.pl\/?p=5647","title":{"rendered":"Do\u0142\u0105cz do FunDive! Projektu po\u015bwi\u0119conego lepszemu poznaniu r\u00f3\u017cnorodno\u015bci grzyb\u00f3w"},"content":{"rendered":"\n
\"\"<\/a><\/figure><\/div>\n\n\n\n

2 stycznia 2024 roku ruszy\u0142a realizacja projektu FunDive \u201eMonitorowanie i mapowanie r\u00f3\u017cnorodno\u015bci grzyb\u00f3w na potrzeby ochrony przyrody\u201d (<\/strong>https:\/\/fun-dive.eu\/<\/strong><\/a>)<\/strong>, wsp\u00f3\u0142finansowanego przez Biodiversa+ Partnership oraz Narodowe Centrum Nauki w\u00a0ramach programu BiodivMon. Projekt jest realizowany oficjalnie przez konsorcjum 26 partner\u00f3w z\u00a017\u00a0kraj\u00f3w. Koordynatorami polskiej cz\u0119\u015bci projektu jest Uniwersytet Warszawski oraz Polskie Towarzystwo Mykologiczne. Warto jednak zaznaczy\u0107, \u017ce\u00a0projekt jest otwarty i ka\u017cdy mykolog mo\u017ce si\u0119 w\u0142\u0105czy\u0107 w realizacj\u0119 r\u00f3\u017cnych zada\u0144, kt\u00f3re maj\u0105 zapewnione finansowanie.<\/strong> G\u0142\u00f3wnym celem projektu jest wypracowanie wsp\u00f3lnych europejskich standard\u00f3w monitoringowych i integracja danych o r\u00f3\u017cnorodno\u015bci biologicznej grzyb\u00f3w, co ma si\u0119 prze\u0142o\u017cy\u0107 na obj\u0119cie grzyb\u00f3w lepsz\u0105 ochron\u0105.<\/strong> Ma on zosta\u0107 osi\u0105gni\u0119ty dzi\u0119ki realizacji pi\u0119ciu przedstawionych poni\u017cej pakiet\u00f3w zada\u0144:<\/p>\n\n\n\n

Pakiet 1. Taksonomia<\/strong>

Realizacja tego pakietu polega na zsekwencjonowaniu wybranych marker\u00f3w molekularnych dla jak najwi\u0119kszej liczby okaz\u00f3w z materia\u0142\u00f3w typowych zdeponowanych w europejskich zielnikach. Wiadomo, \u017ce wiele z obecnie opisywanych gatunk\u00f3w nowych dla nauki reprezentuje gatunki wcze\u015bniej ju\u017c opisane, ale nie maj\u0105ce swoich sekwencji referencyjnych w\u00a0bankach gen\u00f3w. Uzyskanie takich sekwencji by\u0142o kiedy\u015b bardzo trudnym zadaniem. Wsp\u00f3\u0142czesne metody sekwencjonowania nowej generacji umo\u017cliwiaj\u0105 uzyskanie sekwencji, kt\u00f3rych kiedy\u015b uzyska\u0107 si\u0119 nie dawa\u0142o. Ta zmiana spowodowa\u0142a, \u017ce wiele \u015bwiatowych zielnik\u00f3w, m.in. Kew Gardens, od kilku lat z powodzeniem realizuje ju\u017c projekty polegaj\u0105ce na\u00a0takim sekwencjonowaniu. Celem FunDive jest umo\u017cliwienie uzyskania sekwencji markerowych z okaz\u00f3w typowych grzyb\u00f3w zdeponowanych tak\u017ce we wszystkich polskich kolekcjach grzybowych<\/strong>. Technicznie realizacj\u0119 tego zadania koordynuje zesp\u00f3\u0142 holenderski z\u00a0Naturalis Biodiversity Center. Sekwencjonowanie mo\u017ce si\u0119 odby\u0107 w Holandii, ale je\u015bli nie chcesz, aby cenne okazy opu\u015bci\u0142y mury zielnika, nasz zesp\u00f3\u0142 mo\u017ce przyjecha\u0107 do Ciebie i przeprowadzi\u0107 ekstrakcj\u0119 DNA na miejscu. Wszystkie uzyskane dane zostan\u0105 przekazane kolekcjom oraz udost\u0119pnione w publicznych repozytoriach zgodnie ze standardami FAIR.

Jak mo\u017cesz si\u0119 w\u0142\u0105czy\u0107? Je\u015bli jeste\u015b kuratorem zielnika i w zarz\u0105dzanej przez Ciebie kolekcji s\u0105\u00a0okazy typowe, kt\u00f3rych wybrane markery molekularne chcia\u0142by\u015b zsekwencjonowa\u0107, zg\u0142o\u015b si\u0119 do Julii Paw\u0142owskiej (julia.z.pawlowska@uw.pl<\/a>), kt\u00f3ra pomo\u017ce Ci nawi\u0105za\u0107 kontakt z\u00a0koordynatorem zadania.<\/p>\n\n\n\n

Pakiet 2. Sztuczna Inteligencja (AI)<\/strong>

Realizacja tego pakietu polega na rozwijaniu i doskonaleniu narz\u0119dzi wykorzystuj\u0105cych sztuczn\u0105 inteligencj\u0119 (artificial inteligece \u2013 AI) do rozpoznawania grzyb\u00f3w.

Jak mo\u017cesz si\u0119 w\u0142\u0105czy\u0107? Zach\u0119camy do zainstalowania i\u00a0aktualizacji aplikacji PlutofGO <\/strong>(do pobrania za darmo w appstore: https:\/\/play.google.com\/store\/apps\/details?id=com.plutof.go&hl=en_US<\/a>), kt\u00f3ra dzi\u0119ki projektowi od kilku tygodni ma ju\u017c tak\u0105 opcj\u0119.<\/p>\n\n\n\n

Pakiet 3. Nauka obywatelska<\/strong>

Realizacja tego pakietu polega na zaanga\u017cowaniu jak najszerszej grupy os\u00f3b w mapowanie rozmieszczenia grzyb\u00f3w w Europie oraz otwarciu dost\u0119pu do metod molekularnych dla\u00a0wszystkich mykolog\u00f3w. <\/strong>Co roku, koordynatorzy projektu b\u0119d\u0105 og\u0142asza\u0107 na stronie internetowej (https:\/\/fun-dive.eu\/get-involved\/<\/a>) tzw. \u201ekampanie\u201d. B\u0119d\u0105 to listy gatunk\u00f3w i\u00a0rodzaj\u00f3w grzyb\u00f3w, na kt\u00f3rych szczeg\u00f3lnie nam w danym roku zale\u017cy. 5 sierpnia 2024 roku uruchomione zostan\u0105 kampanie po\u015bwi\u0119cone rodzajom Geastrum <\/em>i Tulostoma. <\/em>Wyb\u00f3r tych rodzaj\u00f3w jest podyktowany faktem, \u017ce obecnie ich status jest oceniany przez IUCN w ramach inicjatywy tworzenia europejskiej czerwonej listy grzyb\u00f3w. Warto jednak pami\u0119ta\u0107, \u017ce w Polsce wiele gatunk\u00f3w w obr\u0119bie tych rodzaj\u00f3w jest obj\u0119tych ochron\u0105. Wyst\u0105pienia tych gatunk\u00f3w nale\u017cy dokumentowa\u0107 jedynie fotograficznie.<\/p>\n\n\n\n

Tak jak ka\u017cdy gatunek ma swoje cechy zewn\u0119trzne po kt\u00f3rych jest identyfikowany, tak r\u00f3wnie\u017c ma specyficzne sekwencje DNA, kt\u00f3re s\u0105 nazywane sekwencjami markerowymi, markerami molekularnymi czy barkodami. To ostatnie wyra\u017cenie jest analogi\u0105 do kod\u00f3w kreskowych na produktach, po kt\u00f3rych system obs\u0142uguj\u0105cy kasy bezb\u0142\u0119dnie rozpoznaje towar. Grzyb, kt\u00f3rego marker molekularny jest poznany, jest precyzyjnie zidentyfikowany, r\u00f3wnie\u017c wtedy gdy na skutek przechowywania straci swoje cechy charakterystyczne (np. barw\u0119, zapach, zmieni wielko\u015b\u0107 lub kolor). W ramach projektu zamierzamy uzyska\u0107 sekwencje molekularne dla wi\u0119kszo\u015bci zg\u0142oszonych i zebranych okaz\u00f3w tych gatunk\u00f3w.<\/p>\n\n\n\n

Podobnie, we wszystkich kolejnych kampaniach b\u0119dziemy si\u0119 skupia\u0107 na uzyskiwaniu sekwencji markerowych dla wszystkich zebranych okaz\u00f3w. Ka\u017cdy zarejestrowany i zg\u0142oszony do projektu okaz b\u0119dzie mo\u017cna obserwowa\u0107 na naszej stronie internetowej: https:\/\/fun-dive.eu\/dataportal\/<\/a>. Tam te\u017c udost\u0119pnione b\u0119d\u0105 sekwencje wybranych marker\u00f3w molekularnych, tak \u017ceby ka\u017cda osoba, kt\u00f3ra do\u0142\u0105czy do projektu mog\u0142a sama korzysta\u0107 i analizowa\u0107 sekwencje ze swojego okazu. Wszystkie uzyskane w ramach projektu sekwencje zostan\u0105 tak\u017ce udost\u0119pnione w publicznych repozytoriach (GBIF, ENA) na zasadach FAIR. Wszystkie osoby, kt\u00f3re dostarcz\u0105 danych w ramach kolejnych kampanii b\u0119d\u0105 wsp\u00f3\u0142autorami publikacji prezentuj\u0105cych te dane.<\/p>\n\n\n\n

Jak mo\u017cesz si\u0119 w\u0142\u0105czy\u0107? \u015aled\u017a informacje na stronie https:\/\/fun-dive.eu\/get-involved\/<\/a>. Do\u0142\u0105cz do\u00a0projektu \u201eCitizens for FunDive\u201d w aplikacji PlutofGO i zapraszamy do ruszania w teren. Je\u015bli posiadasz wi\u0119ksz\u0105 kolekcj\u0119 okaz\u00f3w z rodzaju, kt\u00f3ry nas interesuje zapraszamy do\u00a0kontaktu z Juli\u0105 Paw\u0142owsk\u0105 (julia.z.pawlowska@uw.edu.pl<\/a>). Je\u015bli chcia\u0142by\u015b, aby Twoja organizacja do\u0142\u0105czy\u0142a do projektu FunDive jako \u201ecollaborating partner\u201d, tak\u017ce zapraszamy do\u00a0kontaktu.<\/p>\n\n\n\n

Pakiet 4. \u015arodowiskowe DNA<\/strong><\/p>\n\n\n\n

Celem tego pakietu jest pobranie pr\u00f3b i zsekwencjonowanie \u015brodowiskowego DNA z las\u00f3w sosnowych w ca\u0142ej Europie w wystandaryzowany spos\u00f3b. Chcemy por\u00f3wna\u0107, czy metody monitoringu oparte o metody molekularne s\u0105 skuteczniejsze, ni\u017c klasyczne inwentaryzacje mykologiczne, zw\u0142aszcza je\u015bli chodzi o ich skuteczno\u015b\u0107 w wykrywaniu gatunk\u00f3w rzadkich i chronionych.<\/p>\n\n\n\n

Jak mo\u017cesz si\u0119 w\u0142\u0105czy\u0107? Je\u015bli znasz w swojej okolicy szczeg\u00f3lnie atrakcyjne i cenne przyrodniczo lasy sosnowe, albo chcia\u0142by\u015b wzi\u0105\u0107 udzia\u0142 w pobieraniu pr\u00f3b w terenie, zapraszamy do kontaktu.<\/p>\n\n\n\n

Pakiet 5. Analiza danych<\/strong><\/p>\n\n\n\n

Realizacja tego pakietu polega na metaanalizie du\u017cych zestaw\u00f3w danych, w celu zrozumienia trend\u00f3w i czynnik\u00f3w wp\u0142ywaj\u0105cych na obecne rozmieszczenie gatunk\u00f3w grzyb\u00f3w. Ten pakiet zada\u0144 jest koordynowany przez analityk\u00f3w z uniwersytetu w Bayreuth.<\/p>\n\n\n\n

Jak mo\u017cesz si\u0119 w\u0142\u0105czy\u0107? Je\u015bli jeste\u015b analitykiem danych, chc\u0105cych zaj\u0105\u0107 si\u0119 badaniem grzyb\u00f3w, zapraszamy do kontaktu.<\/p>\n\n\n\n

Pierwsze aktywno\u015bci w ramach projektu b\u0119d\u0105 uruchomione ju\u017c w tym roku. Zach\u0119camy do do\u0142\u0105czenia do nas. \u0141\u0105cz\u0105c nasze si\u0142y mo\u017cemy lepiej pozna\u0107 \u015bwiat grzyb\u00f3w! <\/strong>Je\u015bli macie Pa\u0144stwo jakiekolwiek sugestie lub pytania zwi\u0105zane z projektem, zapraszamy do kontaktu z Juli\u0105 Paw\u0142owsk\u0105 (julia.z.pawlowska@uw.edu.pl<\/a>).<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

2 stycznia 2024 roku ruszy\u0142a realizacja projektu FunDive \u201eMonitorowanie i mapowanie r\u00f3\u017cnorodno\u015bci grzyb\u00f3w na potrzeby ochrony przyrody\u201d (https:\/\/fun-dive.eu\/), wsp\u00f3\u0142finansowanego przez Biodiversa+ Partnership oraz Narodowe Centrum Nauki w\u00a0ramach programu BiodivMon. Projekt jest realizowany oficjalnie przez konsorcjum 26 partner\u00f3w z\u00a017\u00a0kraj\u00f3w. Koordynatorami polskiej … Czytaj dalej →<\/span><\/a><\/p>\n","protected":false},"author":1,"featured_media":0,"comment_status":"closed","ping_status":"closed","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"footnotes":""},"categories":[4],"tags":[],"class_list":["post-5647","post","type-post","status-publish","format-standard","hentry","category-aktualnosci"],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/www.ptmyk.pl\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts\/5647","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/www.ptmyk.pl\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/www.ptmyk.pl\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.ptmyk.pl\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/users\/1"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.ptmyk.pl\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fcomments&post=5647"}],"version-history":[{"count":1,"href":"https:\/\/www.ptmyk.pl\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts\/5647\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":5648,"href":"https:\/\/www.ptmyk.pl\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts\/5647\/revisions\/5648"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/www.ptmyk.pl\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fmedia&parent=5647"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.ptmyk.pl\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fcategories&post=5647"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.ptmyk.pl\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Ftags&post=5647"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}